Modesto Orozco: "La simulación es el nuevo microscopio molecular"

“Creo que el premio Nobel de este año es un reconocimiento a todo un campo de investigación que ayuda a entender cómo funciona la vida a nivel molecular y está revolucionando la visión que tenemos de los seres vivos”, explica Modesto Orozco, especialista en modelización y bioinformática del Instituto de Investigación Biomédica (IRB Barcelona). Orozco es una de las autoridades internacionales en biosimulación a escala molecular y junto a Charles A. Laughton, de la Universidad de Nottingham, ha citado en Barcelona a las abanderados del campo para discutir las investigaciones actuales. Será durante el 4, 5 y 6 de noviembre, en la XXII Conferencia Barcelona Biomed, el programa de conferencias científicas del IRB Barcelona, que aglutina a 150 especialistas en una atmósfera de “think tank”, y que están financiadas por la Fundación BBVA. Las reuniones se celebran en el Institut d’Estudis Catalans.

Expertos de Nobel

El trabajo de los invitados encuentra sus raíces en el de los premios Nobel, Martin Karplus, Arieh Warshel y Michael Levitt. Jiali Gao, de la Universidad de Minnesota, trabajó con Martin Karplus en Harvard, siendo uno de sus investigadores postdoctorales más notables y una de las personas que aparecen en la “Nobel Citation”. Gao es hoy un científico reconocido mundialmente por sus contribuciones teóricas a la simulación de las catálisis enzimáticas. El italiano Michele Parrinello, del Instituto Tecnológico de Zúrich, en Suiza, es el científico que más ha contribuido, según Orozco, a desarrollar la dinámica molecular, la simulación computacional de los movimientos físicos de átomos y moléculas. El método “Car-Parrinello Molecular Dynamics (CP/MD)” es uno de los más usados para estudiar el comportamiento de nuevos materiales o la reactividad enzimática.Parrinello figura entre los científicos más citados del mundo y su contribución al campo aparece también en la “Nobel Citation”.

Helmuth Grubmuller, Erik Lindahl, Mark Samson, Gerhard Hummer, Richard Lavery, Adrian Muholan, F.Javier Luque y hasta los veinte expertos invitados trabajan en el desarrollo de códigos, algoritmos, y herramientas de simulación molecular en un área común donde convergen expertos en química y biología computacional, biología estructural, biofísica y bioinformática y empujan el desarrollo de la dinámica molecular para la simulación de sistemas biológicos.

“La supercomputación aplicada a la biología, nos está dando la capacidad de entender cómo funcionan los sistemas biológicos, de comprender, por ejemplo, cómo son, cómo se mueven y cómo interaccionan las proteínas, nano-máquinas que están en constante movimiento”, dice Orozco. “Esto ha tenido un impacto tremendo en la industria farmacéutica porque permite abordar el diseño racional de fármacos, en lugar del método tradicional de sintetizar decenas de miles de compuestos guiados por el azar o la intuición”. Según el investigador del IRB, catedrático de la UB, que también dirige el programa conjunto de investigación en biología computacional del IRB y el Barcelona Supercomputing Center (BSC), “existen muy pocos fármacos hoy que antes de alcanzar el mercado no hayan pasado primero por este tipo de pruebas de simulación”.