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Conhecidas desde o século IX pelos árabes e persas, as ilhas Comores eram um entreposto comercial fundamental para o fluxo de minérios do Zimbábue e os portos de Áden e Dar es Salaam.
Foram colônia islmica entre os séculos IX e XIX, inicialmente sob controle Abássida e posteriormente, Otomano. A partir do século XIX, com a desintegração dos impérios islmicos, as ilhas foram anexadas pela França, juntamente com Mayotte e Reunião.
Em 1975, tornaram-se independentes e passaram a formar a República Federal Islmica das Comores, com três das quatro ilhas originais do antiga colônia. Hoje integram a Liga Árabe e a Organização da Conferência Islmica.