Il 13 maggio 1917, era a Cova da Iria (Conca di Iria), vicino alla cittadina di Fatima, in Portogallo, insieme al fratello maggiore Francisco e alla cugina Lucia dos Santos a badare al gregge, quando videro apparire una "Signora": la Madonna. La storia vuole che la Madonna avrebbe rivelato ai tre pastorelli tre segreti, ovvero i "Segreti di Fatima". Le apparizioni continuarono fino al 13 ottobre 1917, quando avvenne il Miracolo del sole. Secondo quanto raccontato da Lucia, all'epoca Giacinta era una bambina come tante altre: le piaceva giocare e ballare ed era un po’ permalosa. Dopo l'incontro con la Madonna, però, la sua vita e le sue abitudini cambiarono: Giacinta prega molto, fino a quando, il 23 dicembre 1918, viene colpita assieme al fratello Francisco, dal terribile virus della spagnola. Rispetto al fratello la malattia fu più lunga e dolorosa, ma, secondo i racconti di Lucia, riuscì a sopportarla. Venne anche ricoverata, inutilmente, all'ospedale di Lisbona dove i medici tentarono di tutto. La bambina morì il 20 febbraio 1920. Venne beatificata da Giovanni Paolo II il 13 maggio 2000.